В Никарагуа тропический климат с пассатами. Температура в самый холодный месяц (январь) на высоте 1500 м составляет +16°C. Восточные части территории, подверженные пассатам, могут получать до 5000 мм осадков в год.
Карибское побережье характеризуется жарким и влажным климатом, с осадками даже в короткий сухой сезон (март—май). Дальше на запад количество осадков уменьшается. В стране два четко выраженных сезона: сухой (декабрь—апрель, часто также май) и дождливый (май—ноябрь), со средними дневными температурами в сухой сезон от 24 до 32°C. Годовое количество осадков колеблется от 1000 до 6500 мм (в горах). Разрушительные тропические ураганы — обычное явление.
Лучшее время для посещения тихоокеанских регионов и центральных частей страны — сухой сезон с декабря по январь.